Desember 9, 2021

DOKTER INDONESIA ONLINE

The Science Of Update Physician Practice

10 Virus Corona SARS-CoV-2 Varian Baru dan Atributnya

8 min read
Spread the love

10 Virus Corona Varian Baru dan Atributnya

Audi Yudhasmara, Widodo Judarwanto

Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) mengumumkan adanya pemberian 10 nama-nama baru bagi varian virus corona yang telah terdeteksi di sejumlah negara. Penamaan ini dilakukan setelah sejumlah pertimbangan serta adanya konsultasi luas dan tinjauan dari banyak sistem penamaan potensial.

Varian genetik SARS-CoV-2 telah muncul dan beredar di seluruh dunia selama pandemi COVID-19. Mutasi dan varian virus di Amerika Serikat dipantau secara rutin melalui surveilans berbasis urutan, studi laboratorium, dan investigasi epidemiologi.
Kelompok antarlembaga SARS-CoV-2 Interagency Group (SIG) pemerintah AS mengembangkan skema Klasifikasi Varian yang mendefinisikan tiga kelas varian SARS-CoV-2: Varian Minat, Varian Kepedulian dan Varian High Consequence
Varian B.1.1.7 (Alpha), B.1.351 (Beta), B.1.617.2 (Delta), dan P.1 (Gamma), yang beredar di Amerika Serikat diklasifikasikan sebagai varian yang menjadi perhatian.
Sampai saat ini, tidak ada varian konsekuensi tinggi yang telah diidentifikasi di Amerika Serikat.

Studi laboratorium menunjukkan perawatan antibodi monoklonal spesifik mungkin kurang efektif untuk mengobati kasus COVID-19 yang disebabkan oleh varian dengan substitusi atau kombinasi substitusi tertentu dalam protein lonjakan.

L452R hadir dalam garis keturunan B.1.526 (Iota), B.1.427 (Epsilon), dan B.1.429 (Epsilon), serta garis keturunan dan sub-garis keturunan B.1.617 (Kappa, Delta).
E484K hadir dalam B.1.525 (Eta), P.2 (Zeta), P.1 (Gamma), dan B.1.351 (Beta), tetapi hanya beberapa strain B.1.526 (Iota) dan B.1.1.7 (Alfa). Kombinasi substitusi K417N, E484K, dan N501Y terdapat pada B.1.351 (Beta). Kombinasi substitusi K417T, E484K, dan N501Y terdapat pada P.1 (Gamma).

WHO mengumpulkan sekelompok ahli mitra dari seluruh dunia untuk melakukannya, termasuk para ahli yang merupakan bagian dari sistem penamaan yang ada, ahli nomenklatur dan taksonomi virus, peneliti dan otoritas nasional.

WHO memutuskan memberikan nama-nama baru bagi varian virus corona yang tidak terkait dengan suatu negara, namun masih tetap mudah diingat. Nama tersebut menggunakan alfabet Yunani. Sehingga tidak ada negara yang boleh distigmatisasi karena mendeteksi dan melaporkan varian.

Klasifikasi varian

Departemen Kesehatan dan Layanan Kemanusiaan (HHS) AS membentuk Kelompok Antarlembaga (SIG) SARS-CoV-2 untuk meningkatkan koordinasi antara Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit (CDC), Institut Kesehatan Nasional (NIH), Administrasi Makanan dan Obat-obatan (FDA), Biomedical Advanced Research and Development Authority (BARDA), dan Departemen Pertahanan (DoD). Kelompok antarlembaga ini berfokus pada karakterisasi cepat dari varian yang muncul dan secara aktif memantau potensi dampaknya pada penanggulangan kritis SARS-CoV-2, termasuk vaksin, terapi, dan diagnostik.

  • Variant of Interest (VOI)– Lihat VOI saat ini di Amerika Serikat yang sedang dipantau dan dicirikan
  • Variant of Concern (VOC) – Lihat VOC saat ini di Amerika Serikat yang dipantau secara ketat dan ditandai oleh agen federal
  • Variant of High Consequence (VOHC) – Saat ini belum ada varian SARS-CoV-2 yang naik ke level high konsekuensi

Setiap klasifikasi varian mencakup kemungkinan atribut dari kelas bawah (yaitu, VOC menyertakan kemungkinan atribut VOI); status varian mungkin meningkat atau menurun berdasarkan bukti ilmiah yang muncul. Halaman ini akan diperbarui sesuai kebutuhan untuk menampilkan varian yang dimiliki setiap kelas. Ikon eksternal Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) juga mengklasifikasikan virus varian sebagai Varian Perhatian dan Varian Kepentingan; Klasifikasi AS mungkin berbeda dari WHO karena pentingnya varian mungkin berbeda menurut lokasi. Untuk membantu diskusi publik tentang varian, WHO mengusulkan penggunaan label yang terdiri dari Alfabet Yunani, yaitu Alfa, Beta, Gamma, sebagai cara praktis untuk mendiskusikan varian oleh audiens non-ilmiah. Label yang ditetapkan untuk setiap varian disediakan dalam tabel di bawah ini.

Varian of Interest

  • Varian dengan penanda genetik spesifik yang telah dikaitkan dengan perubahan pada pengikatan reseptor, pengurangan netralisasi oleh antibodi yang dihasilkan terhadap infeksi atau vaksinasi sebelumnya, pengurangan kemanjuran pengobatan, dampak diagnostik potensial, atau prediksi peningkatan penularan atau keparahan penyakit.

Kemungkinan atribut dari varian of interest

  • Penanda genetik spesifik yang diperkirakan mempengaruhi transmisi, diagnostik, terapeutik, atau pelarian imun.
  • Bukti bahwa itu adalah penyebab peningkatan proporsi kasus atau kelompok wabah yang unik.
  • Prevalensi atau ekspansi terbatas di AS atau di negara lain.
  • Varian kepentingan mungkin memerlukan satu atau lebih tindakan kesehatan masyarakat yang tepat, termasuk pengawasan urutan yang ditingkatkan, karakterisasi laboratorium yang ditingkatkan, atau penyelidikan epidemiologis untuk menilai seberapa mudah virus menyebar ke orang lain, tingkat keparahan penyakit, kemanjuran terapi, dan efekyofitas vaksin saat ini

10 varian baru Virus Corona SARS-CoV-2

  1. Varian virus corona Inggris B.1.1.7 disebut Varian Alpha Varian. B.1.1.7 merupakan varian virus corona yang pertama kali muncul di Inggris pada Desember 2020. Studi awal mengenai varian baru virus corona tersebut menunjukkan potensi peningkatan penularan dan rawat inap.
  2. Varian virus corona Afrika Selatan B.1.351 disebut Beta. Virus corona varian B.1.351 pertama kali ditemukan di Teluk Nelson Mandela, Afrika Selatan pada Oktober 2020. Dikutip dari Kompas.com (3/5/2021) varian virus corona B.1351 bisa mempengaruhi netralisasi beberapa antibody, akan tetapi belum terdeteksi apakah jenis tersebut mampu meningkatkan risiko keparahan penyakit. Diduga varian virus corona Beta ini mempengaruhi penurunan efikasi vaksin Covid-19. Varian virus corona Beta ini juga memiliki kemampuan penularan yang lebih cepat dan berpotensi mengakibatkan kematian yang tinggi.
  3. Varian virus corona Brasil P.1 disebut Varian Gamma. Varian Gama atau P.1 merupakan varian virus corona yang ditemukan di Brasil. Varian virus corona Gama ini juga sama dengan varian B.1.352 ditemukan lolos dari netralisasi saat diinkubasi dengan antibody yang dihasilkan sebagai respon terhadap gelombang pertama pandemi.
  4. Varian India B.1.617.2 disebut Delta. Virus corona varian B.1.617 merupakan varian baru dari mutasi ganda E484Q dan L452R. E484Q mirip dengan E484K, yang merupakan mutasi yang terlihat pada varian Afrika Selatan B.13.53 dan pada varian Brasil, P1. Adapun L452R juga terdeteksi dalam varian virus California, B.1.429. Varian virus corona Delta ini diangggap lebih menular dan bisa menyebar lebih cepat. Varian virus corona Delta juga sudah menyebar ke sejumlah wilayah di Indonesi antara lain Jakarta. B.1.617.3  Substitusi Protein Spike: T19R, G142D, L452R, E484Q, D614G, P681R, D950N. Nama b: 20A. Pertama Diidentifikasi: India – Oktober 2020. SAtribut: Potensi pengurangan netralisasi oleh beberapa perawatan antibodi monoklonal EUA7, 14 Potensi pengurangan netralisasi oleh serum pasca-vaksinasi26
  5. Varian Amerika Serikat B.1.427/B.1.429 disebut Epsilon. Varian virus corona baru ini merupakan varian Callifornia. Melansir dari CNBC, varian virus corona Epsilon ini diperkirakan menyumbang 52 persen kasus Covid di California, 41 persen di Nevada, dan 25 persen di Arizona. CDC juga telah mengklasifikasikan varian virus corona Epsilon ini sebagai varian kekhawatiran yang berarti ada bukti bahwa varian ini mengarah pada peningkatan penularan dan penyakit yang lebih parah. Substitusi Protein Spike: L452R, D614G. Nama: 20C/S:452R. Label WHO: Epsilon. Pertama Diidentifikasi: Amerika Serikat- (California). Atribut:~ 20% peningkatan transmisi. Sedikit penurunan kerentanan terhadap kombinasi bamlanivimab dan etesevimab; namun, implikasi klinis dari penurunan ini tidak diketahui. Tersedia pengobatan antibodi monoklonal alternatif. Pengurangan netralisasi dengan serum pemulihan dan pasca-vaksinasi. Deeskalasi dari VOC pada 29 Juni 2021, karena penurunan yang signifikan dalam proporsi virus garis keturunan B.1.427 yang beredar secara nasional dan data yang tersedia menunjukkan bahwa vaksin dan perawatan efektif terhadap varian ini.
  6. Varian virus corona Brasil P.2 disebut Zeta. Varian P2 adalah varian virus corona lain selain varian P1 yang terdeteksi lebih dulu di Brazil. Varian virus corona Zeta ini juga telah terdeteksi lebih dahulu di Inggris dan dilaporkan menyebar di Rio de Janeiro. Varian virus corona Zeta ini meskipun mengandung E484K namun diangggap tak cukup untuk menetapkannya masuk sebagai Varian kekhawatiran. Melansir dari Belfasttelegraph Varian virus corona Zeta tidak mengandung mutasi penting lain sebagaimana yang dibawa varian P1.  Substitusi Protein Spike: E484K, (F565L*), D614G, V1176F. Nama: 20J. Label WHO: Zeta. Pertama Diidentifikasi: Brasil – April 2020. Atribut: Potensi pengurangan netralisasi oleh beberapa perawatan antibodi monoklonal EUA. Mengurangi netralisasi dengan serum pasca-vaksinasi22, 2
  7. Varian B.1.525 disebut Eta. Virus corona variaan B.1525 adalah varian yang baru-baru ini diidentifikasi di Inggris. Para ilmuwan mengawasi varian virus corona Eta ini karena memiliki beberapa mutasi pada gen protein lonjakan. Mutasi tersebut atermasuk adanya E484 K. Meski demikian sejauh ini tak ada bukti bahwa virus corona Eta lebih menular atau mengarah ke penyakit yang lebih parah. B.1.525. Substitusi Protein Spike: A67V, 69del, 70del, 144del, E484K, D614G, Q677H, F888L. Nama: 20A/S:484K. Label WHO: Eta. Pertama Diidentifikasi: Inggris Raya/Nigeria – Desember 2020. Atribut: Potensi pengurangan netralisasi oleh beberapa perawatan antibodi monoklonal Emergency Use Authorization (EUA). Potensi pengurangan netralisasi oleh serum pemulihan dan pasca-vaksinasi
  8. Varian Filipina P.3 disebut Theta. Varian virus corona asal Filipina ini dideteksi di Filipina pada 13 Maret 2021 dan ditemukan pada sampel lokal Filipina. Mengutip dari Rappler, meskipun belum cukup bukti varian virus corona Theta tersebut berdampak pada kesehatan masyarakat namun tetap ada kemungkinan virus lebih menular dibandingkan versi asli SARS-CoV-2.
  9. Varian Amerika Serikat B.1.526 disebut Iota. Virus corona varian B.1526 mulai ditemukan pada sampel yang dikumpulkan di New York pada Bulan November 2021. Belum diketahui apakah varian virus corona Iota lebih menular dibandingkan virus aslinya. Virus virus corona Iota juga belum tersebar luas, namun tampaknya menyebar cukup efisien melalui wilayah metropolitan New York dan sekitarnya. Substitusi Protein Spike: L5F, (D80G*), T95I, (Y144-*), (F157S*), D253G, (L452R*), (S477N*), E484K, D614G, A701V, (T859N*), (D950H* ), (Q957R*). Nama : 20C/S:484K. Label WHO: Iota. Pertama Diidentifikasi: Amerika Serikat (New York) – November 2020. Isolat Referensi BEI: NR-55359. Atribut: Berkurangnya kerentanan terhadap kombinasi pengobatan antibodi monoklonal bamlanivimab dan etesevimab; namun, implikasi klinis dari hal ini tidak diketahui. 7 Perawatan antibodi monoklonal alternatif tersedia Mengurangi netralisasi dengan serum pemulihan dan pasca-vaksinasi
  10. Varian India B.1.617.1 disebut Kappa. Varian virus corona Kappa merupakan varian baru yang terdiri dari mutasi ganda. Di India, yang melaporkan lebih dari 2,7 juta kasus infeksi, sub-garis keturunan B1617,1 dan B1617,2 ditemukan masing-masing pada 21 persen dan 7 persen dari semua sampel. B1617.1 dan B1617.2 terbukti resisten terhadap antibodi Bamlanivimab yang digunakan untuk pengobatan COVID-19, serta “berkurangnya kerentanan terhadap antibodi netralisasi” untuk B1617.1. Substitusi Protein Spike: (T95I), G142D, E154K, L452R, E484Q, D614G, P681R, Q1071H. Nama : 20A/S:154K. Label WHO: Kappa. Pertama Diidentifikasi: India – Desember 2020. Atribut: Potensi pengurangan netralisasi oleh beberapa perawatan antibodi monoklonal EUA. Potensi pengurangan netralisasi oleh serum pasca-vaksinasi

Tinggalkan Balasan

Alamat email Anda tidak akan dipublikasikan. Ruas yang wajib ditandai *

Copyright © All rights reserved. | Newsphere by AF themes.